ホームページテンプレートを配布サイトからダウンロードして使用する場合、まず気をつけたいのが、
そのテンプレートがWeb標準に則って作成されたものかどうかと言うことを見極めることです。
テーブルレイアウトでタグが組まれているものは、マークアップ自体が間違っているので、避けるようにしましょう。
マークアップの認識が間違っているとそれだけでSEOに不利なサイトが出来上がってしまいます。
SEO対策をしっかりしたい、というのはホームページを作成する人、またホームページオーナーの方誰でも実感していることだと思います。
しかしながら、制作業者にお願いすることなく、一人で一から制作したいと言う方にはホームページテンプレートを利用されることをおすすめします。
なぜなら、ホームページテンプレートはプロによって作られ、XHTML+CSSのウェブ標準に則って作成されているものが多いからです。
配布されたテンプレート内のタグをなるべく変更しないで作成したら良いかと思います。